Pesawat itu berlepas dari Lapangan Terbang Antarabangsa Kunming Changshui ke Lapangan Terbang Antarabangsa Guangzhou Baiyun pada 13:15 waktu tempatan (05:15 UTC)[7] dan dijadualkan mendarat pada 15:05 (07:05 UTC).[8] Pesawat itu telah dijadualkan terbang lebih awal dari Baoshan ke Kunming, tetapi segmen perjalanan ini digantung buat sementara waktu kerana bilangan penumpang yang rendah akibat daripada Pandemik COVID-19 di tanah besar China (Republik Rakyat China).[9][10]

Menurut Pentadbiran Penerbangan Awam China (CAAC), hubungan dengan pesawat itu terputus di bandar Wuzhou.[11] Pada jam 14:22 (06:22 UTC), semasa menghampiri keturunan atas ke Guangzhou, pesawat itu memasuki penurunan curam secara tiba-tiba dari 29,100 kaki (8,900 m). Ia mendatar seketika dan naik dari 7,400 ka (2,300 m) ke 8,600 ka (2,600 m), tetapi kemudian menjunam ke bawah sekali lagi, mencapai ketinggian rekod terakhir 3,225 ka (983 m) kurang daripada dua minit selepas permulaan penurunan, dengan kadar penurunan maksimum hampir 31,000 kaki (9,400 m) seminit.[12] Pesawat itu terhempas di kawasan pergunungan Kaunti Teng, di mana medan serpihan ditemui kemudiannya.[7][13] Media China melaporkan bahawa pesawat itu telah hancur dan menyebabkan kebakaran memusnahkan Buluh di kawasan itu.[14]

Nahas itu dirakamkan oleh kamera keselamatan sebuah syarikat perlombongan tempatan.[15] Penduduk kampung sekitar lokasi nahas terdengar bunyi letupan kuat.[16] Rakaman dari lokasi nahas yang diambil selepas kejadian itu menunjukkan serpihan dan kebakaran. Banyak serpihan yang lebih kecil bertaburan di kawasan sekitar.[17] Kesemua penumpang pesawat itu terbunuh dalam nahas itu.[18] Ini adalah nahas maut pertama yang melibatkan China Eastern Airlines sejak November 2004.[19][20]